基于转录组学和蛋白质组学的高海拔肺动脉高压大鼠模型的新小分子

动脉拉出缩机（PH）是指静息时千分之动脉拉出≥25 mmHg。 它根据血移动力研习相似性、得病有助于和流行病研习研习分为五类。 第三类寒冷动脉拉出缩机（HAPH）是由于在寒冷窒息生态里面肺循环子系统量代偿性增加和肺粘液血管收缩造成的，造成高原心肌病。 针灸症状仅限于运动性头痛、头痛和疲劳。 HAPH 也许反映了未能直接严重影响寒冷，并伴有不可信的流行病研习生理有助于。 大约有 1.4 亿人生活在山坡 2,500 米以上的沿海地区，每年有高达 4,000 万人访问这些寒冷沿海地区。 窒息造成心脏突变解读谱起因差别变立体化； 这大概长年居住在寒冷沿海地区的当地政府及其后代的突变直接严重影响性变立体化里面得知的。HAPH 的立体化疗仍在研究者里面。应以建议患者移至低山坡沿海地区，氧疗必要。药品立体化疗的研究者仅限于一些随机试验。 HAPH 的流行病研习与其他类型的 PH 都与似，因此值得顾虑对 PAH 必要的药品是否对 HAPH 必要。

然而，所有这些类似物药品都在HAPH里面的必要性和有助于尚不可信。为了补救这个问题，我们旨在研究者窒息所关乎的大分子有助于，采用豚鼠 HAPH 静态，并应以用综合多第一组研习步骤。 在此操作过程里面，我们旨在研究者几种类似物药品和复氧的作用，以确定寒冷造成的窒息的潜在新立体化疗靶点。 值得注意是，我们研究者了类似物药品如何严重影响心脏密切关系的差别突变和细胞内解读。

研究者建筑设计：

将豚鼠放于 10% O2（窒息）室里面 3 周以产生 PH。对照豚鼠（C 第一组）在整个实验里面都位处常氧生态下，并在立体化疗后曾（即从第 21 天开始）用小大分子完成立体化疗。 3从前，其余豚鼠随机分为六第一组；一第一组被杀害（第 21 天）以评估癫痫功能性。其余 5 第一组用类似物药品或复氧立体化疗，从第 21 天到第 35 天杀害。慢性窒息，小大分子处理（M）；慢性窒息，司来帕格立体化疗；慢性窒息，佩蒂特替坦立体化疗；慢性窒息，riociguat 立体化疗；慢性窒息、复氧 (RE)。

RNA第一组分析步骤：

提炼出总 RNA，并通过采用 Arraystar rRNA Removal Kit 去掉 rRNA 来氟立体化物 mRNA 和非UTF- RNA。 mRNA 和非UTF- RNA 被完整版立体化缓冲液分解成首集段（~200-500 nt）。以首集段为实例，借助于随机六聚体引物合成第一核酸cDNA。在第二核酸合成操作过程里面，dTTP 被 dUTP 取而代之。 然后加入洗脱缓冲液以通过末端修复和去掉腺嘌呤来转立体化和复合首集段。 首集段被转立体化并与接头连接； 采用尿嘧啶-N-糖基立体化酶消立体化第二条核酸。 琼脂糖凝胶电泳后，为了让合适的完整版作为实例完成PCR逐次。 采用 Agilent 2100 人类分析步骤仪和 ABI StepOnePlus 同步 PCR 受控探针奎完成计量和运动速度评估。 该文奎采用 Illumina HiSeq 2000 子系统完成测序。

LC-MS/MS 分析步骤

在连接到 Easy-nLC 1000 液都与色谱子系统的Q Exactive HF 质谱仪上分析步骤探针。将干燥的肽探针再次溶解在盐酸 A（0.1% 甲酸溶剂）里面并调用到捕集柱里面采用盐酸 A 的最大拉出力为 280 bar，然后在；还有的 150 μm × 30 cm 硅胶微柱上以 5–35% 的梯度完成复合移动都与 B（乙腈和 0.1% 甲酸），流速为 600 nl/min，接下来 150 分钟。 QE HF 的 MS 分析步骤是在 3e6 金属离子的自动增益控制目标下完成一次全成像，然后完成多达 30 次与信息无关的 MS/MS 成像具有更好热量的碰撞人体内，在 Orbitrap 里面侦测到（R = 15,000 在 200 m/z）。

研究者结果：

基于RNA-seq信息的共解读因特网的功能性氟立体化物分析步骤和枢纽站大分子比对。

基于细胞内信息的共解读因特网的功能性氟立体化物分析步骤和枢纽站大分子比对。

RNA-seq 和细胞内第一组研习揭示了对三种药品的反应以密切关系的强无关性，具有依然都与异的效果。GO 氟立体化物显示差别解读的突变仅限于作准备代谢缓冲、RNA和翻译成的突变。

司来帕格、佩蒂特替坦和复氧可提高 HAPH。Serpina1、Cryz 和 Cmc1 被比对出来，通过多第一组研习挑选出，作为作准备HAPH的关键突变。这些推测为 HAPH 的类似物药品有助于提供了在此之后论调。

研究者正确性：

Selexipag、macitentan 和复氧显着消退了豚鼠 HAPH 静态，而 riociguat 的作用要强。 差别解读的突变作准备代谢转录、RNA和翻译成。 某些细胞内受到 HAPH 和立体化疗的严重影响。 我们采用多第一组研习步骤挑选出了关键突变 Serpina1、Cryz 和 Cmc1。 这些推测也许更进一步更好地了解窒息所关乎的大分子有助于，并也许提供在此之后立体化疗靶点。

文献说是：

Xu X, Li H, Wei Q, Li X, Shen Y, Guo G, Chen Y, He K, Liu C. Novel Targets in a High-Altitude Pulmonary Hypertension Rat Model Based on RNA-seq and Proteomics. Front Med (Lausanne). 2021 Nov 3;8:742436. doi: 10.3389/fmed.2021.742436. PMID: 34805208; PMCID: PMC8595261.