Nature:全新致癌性机制,相分离驱动异常染色质成环,促进癌症发展

2021-10-13 09:49 来源:汉中妇科医院

结核病的发展与抗病毒受体质内在无序区外延(IDR)的测序极其密切相关。各种受体质(包括核苷酸位点、肌动受体调节剂和RNA相辅相成受体)中所的IDR通过滴-滴二者错综复杂(LLPS)演化成包容;也,冲击从线粒体演化成和刺激环境温度到测序核苷酸的无数生;也学更全面性。

所谓的滴-滴二者错综复杂(LLPS)是指相结合两个不相关测序凋亡的更全面性。该更全面性愈演愈烈在细胞核内,并能够演化成很强各种;也理结构上的外延,这些外延可以有利于结核病,例如急特质肺癌的愈演愈烈发展。在急特质肺癌中所,原生质受体(NUP98或NUP214)的一一染色体易位产生了一种极其相结合体,它总是保留原生质受体 IDR——苯丙氨酸和氨基酸羧基(FG)的串联分散移位碱基。然而,IDR如何避免测序错误调控和恶特质肿瘤愈演愈烈尚不清楚。

2021年6月23日,北肯塔基大学达勒姆所学院 Gang Greg Wang 小组等 Nature 发表了二本书:Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development 的研究成果科学论文。

该研究成果显然二者错综复杂是结核病演化成的涡轮机状况,结核病通过二者错综复杂获得凋亡以建立联系DEHP核苷酸位点包容;也,这同时全面性提高了它们的测序组抗病毒特质并在恶特质肿瘤转化更全面性中所正向极其三维肌动受体结构的演化成。该研究成果是最先将二者错综复杂与结核病演化成联系起来的研究成果之一。因为在其他恶特质恶特质肿瘤中所推论到了类似的测序相结合,文章中所探究的选择特质也可以解释其他型式的结核病。

NUP98–HOXA9相关联两个受体质基序和一个相辅相成碱基。为了研究成果NUP98-IDR在肺癌愈演愈烈中所的功用,研究成果小组主要使用敲除了相辅相成碱基的NUP98-HOXA9(N-IDRWT/A9)。

他们见到,N-IDRWT/A9对1,6-己二醇(一种用于破坏相-二者错综复杂包容体的有毒)处理敏感。纯化的NUP98-IDR(N-IDR)受体在游离演化成滴体包容;也。

为了全面性评量FG移位碱基对包容;也演化成的沸点发挥作用特质和多价特质的必要特质,研究成果小组制备了含有不同数量FG移位碱基的重新组建N-IDR受体质。他们见到N-IDR相关联38个或36个FG以沸点发挥作用特质的作法移位演化成的滴滴,那些相关联27个或11个FG的却不能同步进行二者错综复杂。断定NUP98–HOXA9中所的IDR以价发挥作用和沸点发挥作用的作法建立联系LLPS。

NUP98–HOXA9通过同源结构外延与DNA相辅相成,避免肺癌愈演愈烈更全面性中所的测序心理因素。接下来,研究成果小组通过肌动受体免疫沉淀和高通量测序来评量IDR诱导的二者错综复杂对NUP98–HOXA9肌动受体抗病毒特质的冲击。

整体而言, N-IDRWT/A9很强敬着全面性提高的测序组占有率,而与无监理聚类定义的峰值亚类无关。此外,宽而密集的超全面性提高子样峰是N-IDRWT/A9所都有的,并且在发育期和肺癌相关测序富含。

为了全面性评量IDR正向的LLPS在平胸肌动受体抗病毒中所的功用,他们利用了生;也学和药理学的方法,显然IDR诱导的LLPS在全面性提高集合体核苷酸位点抗病毒特质方面的因果功用,特别是在超全面性提高子样峰处看到的那些。断定IDR全面性提高相结合体的测序组相辅相成并且全面性提高靶测序抑制。

为了检测NUP98–HOXA9通过LLPS演化成肌动受体周而复始的能力,研究成果小组生成了表达N-IDRWT/A9或N-IDRFS/A9细胞的Hi-C研究成果,揭示了DNA周而复始和复制错综复杂的整体相关特质。

为了确定N-IDRWT/A9对Hi-C带入频率的冲击,他们周围了N-IDRWT/A9-和N-IDRFS/A9表达细胞中所500个最浓烈的N-IDRWT/A9占据位点错综复杂的相互功用计数。整体而言,N-IDRWT/A9周而复始以基本上与CTCF无关的作法演化成,与二者错综复杂涡轮机选择特质一致。另外,N-IDRWT/A9特异特质周而复始重新连接全面性提高子和靶测序错综复杂的连接,支持者了相结合核苷酸位点的IDR通过二者错综复杂在超全面性提高子样抗病毒和退行特质错综复杂正向DNA周而复始的论据。

综上所述,该研究成果见到NUP98–HOXA9中所含有的LLPS活特质IDR对肺癌的愈演愈烈和致退行特质表达程序中的抑制至关重要。这些物理现象由IDR的能力诱导:1)全面性提高核苷酸位点与测序组抗病毒的相辅相成;2)有利于全面性提高子和退行特质启动子错综复杂的中距离周而复始。

该研究成果提供了一个DEHP凋亡的方法特质确实,该凋亡在恶特质肿瘤转化更全面性中所有利于LLPS涡轮机的核苷酸位点相辅相成和3D肌动受体重新组建。由于含IDR的LLPS活特质分子与最常的结核病有关,该研究成果探究的选择特质也可以解释其他型式的结核病。

类似记事:

Ahn, J.H., Davis, E.S., Daugird, T.A. et al. Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03662-5.

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